株式会社テクノスルガ・ラボ 腸内細菌叢や菌類叢解析受託「生体関連アンプリコンシーケンス解析」
- 最終更新日：2022-03-17 09:36:37.0
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〇次世代シーケンサー（MiSeq、Illumina社）によるアンプリコンシーケンス解析です。腸内細菌叢（腸内フローラ）解析、皮膚常在菌叢解析、口腔内細菌叢解析など様々な試料中のマイクロバイオーム解析を受託するサービスです。DNAやRNA抽出、PCR、シーケンス、解析を一括で承ります。ご依頼の際には糞便、腸管内容物、だ液等をご送付ください。納品データは学術論文にも使えます。
〇当社採取キットをご利用頂くことで検体の室温保管が可能です。
〇菌叢解析により得られる結果は特定の菌群の存在比であり絶対量ではありません。リアルタイムPCRを併用することで、DNA量という形で微生物の絶対量も定量できます。
〇サービスのポイント
・優れたコストパフォーマンス
・細菌/アーキアの微生物叢を一括解析
・細菌の約430 bp、アーキアの約385 bp（ペアエンド）長の配列を解析
・ ITS領域により菌類叢を解析
・約10,000リードを取得し占有率の低い分類群も検出
・ RNAの解析にも対応
・取得済み配列データから解析のみのご依頼にも対応
・α、β多様性解析、主成分分析、クラスター解析などのオプションもあり
基本情報腸内細菌叢や菌類叢解析受託「生体関連アンプリコンシーケンス解析」
【解析内容】
○DNA抽出、精製
○PCR増幅、精製
○バイオアナラライザによるPCR産物の品質チェック
○PCR産物の定量
○シーケンス
○DNA塩基配列決定（fastqファイル取得）
○Fastq-joinによるペアエンド配列のアッセンブル
（Fastq-joinファイル取得:MiSeqのみ）
○クオリティフィルタリング（fastaファイル取得）
○データ解析
【データ解析は2種類のソフトウェアから選択可能】
○セット1：Metagenome@KIN
データベース（細菌・酵母）：RDP＋テクノスルガ・ラボ 微生物同定データベース
データベース（真菌）：RDP
○セット2：QIIME2
データベース（細菌・酵母）：Greengenes database
データベース（真菌）：UNITE
【受け入れ可能検体】
A区分：糞便、腸管内容物、 ルーメン液
B区分：唾液、プラーク、皮膚拭取物など
【検体の送付方法】
冷凍や冷蔵など、菌叢変化が少ない方法でご送付ください。糞便の場合冷凍推奨です。当社採取キットを使うと菌叢変化を防ぎつつ冷蔵で輸送可能です。
| 価格情報 |
価格例 〇A区分 セット1 長納期コース(DAN解析のみ40営業日～/RAN解析追加45営業日) 17,600円/検体 セット2 長納期コース(DAN解析のみ40営業日～/RAN解析追加45営業日) 19,800円/検体 〇B区分 セット1 長納期コース(DAN解析のみ40営業日～/RAN解析追加45営業日) 22,000円/検体 セット2 長納期コース(DAN解析のみ40営業日～/RAN解析追加45営業日) 23,100円/検体 価格は税込 詳細については関連リンク参照 |
|---|---|
| 価格帯 | 1万円 ~ 10万円 |
| 納期 |
お問い合わせください
※選択コースによる |
| 用途／実績例 | ・腸内細菌叢（腸内フローラ）解析による機能性食品の評価。 ・食品の機能性による乳酸菌やビフィズス菌の存在比の変化の確認。 ・疾患と腸内細菌叢（腸内フローラ）の関係についての学術研究。 ・口腔内細菌叢（口腔内フローラ）の解析。 ・製品開発のための皮膚常在菌叢（皮膚フローラ）の解析。 ・アンチエイジング研究 |
カタログ腸内細菌叢や菌類叢解析受託「生体関連アンプリコンシーケンス解析」
取扱企業腸内細菌叢や菌類叢解析受託「生体関連アンプリコンシーケンス解析」
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微生物同定試験(細菌・カビ・酵母迅速同定、株識別、微生物特許寄託支援)／微生物分離／菌数測定／抗菌性試験／微生物群集構造解析(土壌等環境検体中の細菌叢・菌類叢解析)／腸内環境分析(採便キット、腸内細菌叢解析、有機酸及び短鎖脂肪酸・胆汁酸・腐敗産物・pH・水分・水分・IgA分析)／微生物分類研究(形態観察、生理・生化学性状試験、分子系統解析、ANI、全ゲノムシーケンス)／微生物試験・分析のためのテクニカルトレーニング／微生物株の保管・管理
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