卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。 【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応 ■目的に応じて使い分け...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

遺伝子発現データベース『GENEVESTIGATOR』

GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレー…

『GENEVESTIGATOR』は、GEOやArrayExpressなどの公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。 【対応生物種：biomedical】 ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、（酵母、大腸菌） ...

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ファジー類似構造検索ツール『FTrees』

類似構造検索やリガンドのデノボデザインを行う創薬支援ツール

『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの 中から検索するBioSolveIT社製のツールです。 ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、 化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すことができます。 当製品は、従来のフィンガープリントを利用した方法では難しかった分子の トポロジーが保存された構造を探索することが...

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ケミカルスペース探索ツールキット『CoLibri』

2つのツールで構成されたケミカルスペース探索ツールキットのご紹介

『CoLibri』は、反応式をもとにフラグメントライブラリーと バーチャルライブラリーを作成するツールです。 ライブラリーは化学反応式に基づいて作成されるため、 より現実的なバーチャル化合物を得ることが可能。 サードパーティとの連携に優れた、BioSolveIT社のソフトウェアです。 【特長】 ■化学反応に基づき試薬構造の一部を反応点で置き換えたフラグメント 　ライブラ...

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対話型 SBDD ツール『SeeSAR』

メディシナルケミストのための受容体ポケット中でのリード最適化ツール

『SeeSAR』は、滑らかで美しい 3D モデルにより、リガンド-受容体間の相互作用を理解し、リガンドの物性値やADMEプロパティを評価しながら、対話的に新規リガンドを設計できるソフトウェアです。 リガンド原子毎の結合自由エネルギー寄与を算出し色付け、ねじれ角の妥当性の検証、リガンドの物性値、ADMEプロパティ、ポケット中の原子の存在しない空間等を分子をマニュアルで編集しながらリアルタイムに...

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BIOVIA COSMOlogic製品 2023年版リリース

新しいプロパティの計算が可能になると共に計算速度が向上！新機能などをご…

2022年12月に『BIOVIA COSMOlogic』製品の2023年版の各製品がリリースされました。 製品としては、BIOVIA COSMOtherm、BIOVIA COSMOconf、BIOVIA COSMObase、BIOVIA COSMOplex&perm、ならびにBIOVIA TURBOMOLEの5製品です。 当資料では、2023年版の新機能や改善された機能についてご紹介。 新しい...

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分子高速アラインメントツール『FlexS』

リガンドの結合様式の解析やバーチャルスクリーニングを行うBioSolv…

『FlexS』は、リガンド構造から予測されるファーマコフォアフィーチャーの 投影点をベースとして構造アラインメントを行い、妥当な重ね合わせ構造を 高速に求めるツールです。 また、高速なスクリーンモードを利用することで受容体構造を用いずに 化合物の3次元構造のみを使用したバーチャルスクリーニングに適用できます。 配置は、ファーマコフォアの投影点の一致（水素結合、イオン結合、疎水性相...

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超高速探索ツール『REAL Space Navigator』

110億化合物の中からリガンド候補を超高速検索できるツールをご紹介

『REAL Space Navigator』は、Enamine社における110億構造におよぶ バーチャル化合物群の中からクエリー化合物に類似の構造を 高速に探索するツールです。 ヒットした構造は同社により実際に合成できる可能性が高く、ユーザーは スキャフォールドホッピングされた新規化合物をオンデマンドに入手可能。 当製品による検索は、BioSolveIT社のFTrees-FSの類...

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FBLDツール『ReCore』

置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支…

『ReCore』は、母核構造置換、フラグメント付加、複数フラグメントの 結合などのFBDDによる分子構築を簡単な操作で行う事が可能なツールです。 受容体ポケットや既存リガンドの形状、フォーマコフォアやSMARTSによる 官能基位置の拘束を分子構築に反映することができます。 また、分子設計手法として、母核構造置換、フラグメント付加、 複数フラグメントの結合の 3 つのモードを用意し...

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リガンド-受容体相互作用2次元図『PoseView』

操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ！

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を 作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類 （水素結合、疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2次元で表示することができます。 得られた図は各種画像フォーマットで出力することが可能です。 【特長】 ■リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を作成 ■...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

リガンド-受容体相互作用 2 次元図『PoseView』

自動的にクオリティの高い図を作成！さまざまな画像フォーマットに対応しま…

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の 2 次元図を作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類（水素結合、 疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2 次元で表示することができます。 操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけで、得られた図は 各種画像フォーマットで出力することが可能 。作成された図は、多くの ...

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