シュレーディンガー株式会社非構造化エピトープとLong CDR H3ループの構造予測に挑む

最終更新日：2023-03-10 09:49:57.0
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十数残基を超える長いCDR H3ループやDisordered エピトープを持つ抗原抗体複合体の構造予測にレプリカ交換MDを応用

シュレーディンガーの創薬プラットフォームは、物理学の第一原理に基づいた計算化学技術を駆使することで、タンパク質立体構造情報に基づく高度な薬物設計を可能とし、世界中の主要製薬企業で活用されています。
弊社のソフトウェアを用いた抗原抗体シミュレーションの最新の成果について、下記セミナーにてご紹介します。

第22回日本蛋白質科学会年会　ランチョンセミナー
【開催日時・場所】
6月7日(火) 12:00 - 12:50
会場：つくば国際会議場2F E会場
セッションID：LS1E
【プログラム】
Schrödinger's approach to physics-based antibody analysis and design: dealing with disordered epitopes and very long CDR H3 loop

企業展示ブースにも出展しておりますので、ぜひお立ち寄りください。シュレーディンガーのBiologics Modeling Suite: BioLumimateをご体験いただけます。

基本情報非構造化エピトープとLong CDR H3ループの構造予測に挑む

本セミナーでは、シュレーディンガーのBiologics Modeling Suite: BioLumimateを用いた一般的な抗体の３Dモデリング技術に加えて、タンパク・タンパク・ドッキングを用いた抗原抗体複合体構造の予測や、自由エネルギー摂動法（FEP）によるアフィニティ・安定性予測などについて解説します。また、単独では特定の安定コンフォメーションを持たないDisorderedエピトープを有する抗原について、MDシミュレーションとOrithogonalな実験データを活用した、抗原・抗体複合体構造推定の可能性について議論します。さらに最近、我々はこの手法が20アミノ酸残基を超えるような長いCDR H3ループを持つ抗体と抗原の複合体構造の予測に対して非常に有効であることを明らかにしました。本セミナーではこの非常に長いH3ループ構造予測の事例について、AlphaFold2による予測結果との比較も交えてご紹介します。

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シュレーディンガー株式会社

【ソフトウェア開発・販売】 ■高速分子シミュレーションにより、ポリマー、有機EL、半導体をはじめとして、さまざまな材料開発を総合支援する Materials Science Suite ■計算化学の導入障壁を取り除く、マテリアルズ・インフォマティクス向けAIプラットフォーム LiveDesign ■製薬およびバイオテクノロジー研究を加速する、化学シミュレーション・ソフトウェア【ソリューション提案・コラボレーション・共同研究】お客様のご状況に応じて、各分野の専門サイエンティストが適切なソリューションをご提案いたします。グローバルな医薬品会社、材料会社との共同研究の実績がございます。